草长莺飞，春暖花开的四月，全国畜牧总站在武汉华中农业大学召开了全国猪基因组选择2018年第二次专家组工作会议。全国畜牧总站杨红杰处长主持会议，陈瑶生、张勤、赵书红等15位专家老师参加此次会议。会议重点是各专家团队展示各自开发的猪基因组选择算法。

在2018年第一次专家组会议上，总站建议各专家团队进行基于SSBLUP方法的算法交流。中国农业大学，华中农业大学，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所和江西农业大学四个团队参与了此次算法的最终展示。

中国农业大学丁向东副研究员作为算法交流技术小组成员首先展示了算法交流数据的模拟情况，重要参数估计以及各团队的结果准确度，结果显示各团队的结果在准确性方面极其相似，不存在问题。而后，丁向东副研究员继续介绍了张勤教授团队开发的算法，团队采用ASREML软件进行传统方差组分估计，实现了标准的SSBLUP算法，并结合Intel MKL函数库进行高性能并行计算加速，计算效率提升显著。

刘小磊副研究员介绍了华中农业大学赵书红教授团队的算法，团队自主开发了基因组选择育种程序包，涵盖了目前已发表的SSBLUP标准算法和近似算法，并提出了一种全新的算法设计，不需要对基于基因型数据构建的亲缘关系矩阵进行求逆，显著降低了计算复杂度，尤其适用于基因芯片较多的大数据分析。此外，团队结合Intel MKL函数库等进行了高性能计算优化，自主开发的程序可对同时整合系谱和基因型信息的双性状10万个体大数据进行方差组分估计，相比国际上已发表的同类软件有显著的计算效率优势。

　 王立刚副研究员展示了中国农业科学院畜牧兽医研究所王立贤研究员团队的算法。团队实现了SSBLUP标准算法，并尝试将用于构建亲缘关系矩阵的基因型标记进行了筛选和权重，从而针对特定性状提高计算效率和预测准确度。

张志燕副教授展示了江西农业大学黄路生院士团队的算法。团队采用SSBLUP近似算法，通过计算效率极高的迭代算法求解混合模型方程式，采用MPI、Intel MKL函数库等进行并行计算加速，显著地提高了计算效率。

此次算法交流展示，各团队各显身手，专家组建议各团队充分交流，取各家之长，为全国猪基因组选择平台搭建最优算法。通过此次交流，年轻技术专家大受鼓舞，均表示将以此为契机，再接再厉，在技术方面争取更大突破，在国际上发出响亮的中国声音！